Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AmbpQ07456 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms