Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Sh3bp2Q06649 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Sh3bp2Q06649 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Sh3bp2Q06649 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Sh3bp2Q06649 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms