Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms