Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin2Q05A80 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms