Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms