Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms