Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms