Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms