Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry1P97784 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cry1P97784 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry1P97784 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cry1P97784 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry1P97784 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms