Protein–RNA interactions for Protein: P97477

Aurka, Aurora kinase A, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkaP97477 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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AurkaP97477 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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AurkaP97477 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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AurkaP97477 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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AurkaP97477 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkaP97477 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkaP97477 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkaP97477 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkaP97477 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkaP97477 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkaP97477 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkaP97477 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkaP97477 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkaP97477 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms