Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas2P97460 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas2P97460 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms