Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

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Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrkdcP97313 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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