Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux2P70298 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cux2P70298 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms