Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfixP70257 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfixP70257 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfixP70257 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfixP70257 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfixP70257 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfixP70257 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfixP70257 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfixP70257 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfixP70257 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfixP70257 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfixP70257 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NfixP70257 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfixP70257 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfixP70257 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfixP70257 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms