Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NficP70255 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NficP70255 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NficP70255 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms