Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms