Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Snrpd3P62320 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms