Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snrpd1P62315 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snrpd1P62315 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms