Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp46P62069 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms