Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms