Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2d1P61080 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms