Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ActbP60710 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ActbP60710 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ActbP60710 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ActbP60710 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ActbP60710 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ActbP60710 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ActbP60710 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ActbP60710 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ActbP60710 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ActbP60710 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ActbP60710 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ActbP60710 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ActbP60710 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms