Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms