Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk2P58801 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms