Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P58686 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P58686 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P58686 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P58686 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P58686 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P58686 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P58686 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
P58686 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
P58686 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P58686 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P58686 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P58686 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P58686 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P58686 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms