Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms