Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp5P56399 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp5P56399 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms