Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GemP55041 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GemP55041 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GemP55041 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms