Protein–RNA interactions for Protein: P53986

Slc16a1, Monocarboxylate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a1P53986 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc16a1P53986 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms