Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Map3k1P53349 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map3k1P53349 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms