Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpbP50405 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms