Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VdrP48281 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VdrP48281 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms