Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh2P43247 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh2P43247 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh2P43247 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms