Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a2P43006 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms