Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf2P39429 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms