Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprkP35822 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprkP35822 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprkP35822 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprkP35822 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprkP35822 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms