Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc1P35601 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms