Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcdP28867 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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