Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxraP28700 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxraP28700 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxraP28700 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxraP28700 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxraP28700 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxraP28700 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxraP28700 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxraP28700 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxraP28700 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxraP28700 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxraP28700 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxraP28700 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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RxraP28700 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RxraP28700 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxraP28700 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxraP28700 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxraP28700 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RxraP28700 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RxraP28700 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RxraP28700 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RxraP28700 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxraP28700 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxraP28700 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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