Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vav1P27870 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms