Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms