Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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