Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tap1P21958 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms