Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a1P19437 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms