Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18527 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18527 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18527 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18527 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18527 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18527 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms