Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhoP15409 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhoP15409 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RhoP15409 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RhoP15409 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RhoP15409 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RhoP15409 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RhoP15409 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RhoP15409 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms