Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Irf1P15314 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Irf1P15314 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf1P15314 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Irf1P15314 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Irf1P15314 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf1P15314 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Irf1P15314 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Irf1P15314 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf1P15314 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf1P15314 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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