Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp1P11438 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms