Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd4P10628 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms