Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Amd1P0DMN7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Amd1P0DMN7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms